Η Παναγία Τριμάρτυρη, αποτελεί τον μητροπολιτικό ναό των Χανίων καθώς και την πολιούχο της πόλης. Χρονολογείται από το 1860, ενώ είναι κτισμένη πάνω στα θεμέλια προγενέστερου Ναού.
Πρόκειται για έναν τρίκλιτο ναό, με το κεντρικό κλίτος να είναι αφιερωμένο στα Εισόδια της Θεοτόκου, το βόρειο στον Άγιο Νικόλαο και το νότιο στους Τρεις Ιεράρχες.
Περίπου το 1645, ο ναός μετατράπηκε σε σαπωνοποιείο από τον Μουσταφά Πασά του οποίου άνηκε η περιοχή, ενώ ο θρύλος λέει ότι μετά από επέμβαση της Παναγίας, άλλαξε γνώμη και επέτρεψε στους χριστιανούς κατοίκους να πραγματοποιήσουν ανέγερση, η οποία και ολοκληρώθηκε το 1860 δίνοντας του την σημερινή μορφή.